まいづる智恵蔵は赤れんが3号棟の別名。元は弾丸や小銃を保管する倉庫として建設され、戦後は民間の倉庫として活用されていたものを、2007（平成19）年に再整備した。
館内1 階には、土産物ショップがあり、地域の特産品が買えるほか、企画展示室や往時の倉庫内や周辺の様子がわかる展示がある。また2階には、旧海軍ゆかりのまち・舞鶴に関する展示がある。