京都の歴史・文化に関する研究支援や学習・交流の新たな拠点として、2017（平成29）年春に新装オープン。府立総合資料館が収集・所蔵してきた約84万冊（点）に加え、府立大・府立医科大附属図書館の所蔵図書約22万、学術雑誌約2000種を閲覧可能となった。展示室では、国宝「東寺百合文書」など貴重な文献資料や美術工芸品を出展する企画展や収蔵品展を開催。1階フロアには交流スペース「京都学ラウンジ」を設け、毎週木曜午後にミニ講座を開講、市民らの学習ニーズに応えている。